Vezető: Prof. Pongor Sándor
Tagok: Dr. Juhász János, Dr. Ligeti Balázs
Kapcsolat: pongor.sandor@itk.ppke.hu
Fő kutatási területünk a bioinformatikai adatok általános elmélete, amely rendszerelméleti és hálózattudományi alapokon nyugszik. Alapvető adattípusaink közé hagyományosan a szekvenciák, a 3D molekuláris struktúrák, a biológiai hálózatok, a genomok és a tudományos irodalom tartoznak, ugyanakkor folyamatosan törekszünk az újonnan megjelenő adattípusok alapelveinek megértésére is. Ezen elméleti háttérre építve kiemelt prioritásunk a BSc-, MSc- és PhD-képzések tantervfejlesztése, amely három fő pillér köré szerveződik:
- A bioinformatika alapjai,
- A tudományos adatok vizualizációja és numerikus reprezentációja,
- Az adatértelmezés és -kommunikáció, beleértve a tudományos írás- és prezentációs készségeket.
Egy másik irányunk a bioinformatikai munkafolyamatok növekvő komplexitásával és átláthatatlanságával foglalkozik, ami komoly kihívást jelent az egyetemes tudományos és etikai normák kialakítása terén is. A mesterséges intelligencia térnyerése új megvilágításba helyezi ezeket a területeket, és tantervfejlesztési törekvéseink is aktívan alkalmazkodnak ehhez a változáshoz. Emellett futó projektjeink elsősorban mikrobiomok elemzésére fókuszálnak; olyan módszertanok kidolgozásán dolgozunk, amelyek lehetővé teszik ezek összetételének és belső hálózatainak feltárását.
A biológiai adatok különböző rétegeit kell összekötnünk, hogy új ismeretekhez juthassunk. Az egyes rétegeken belüli klaszterezés, és a rétegek közötti hozzárendelések bioinformatikai eszközei alapvetőek a tudományos információ adatbázisokba való rendezéséhez, strukturált tárolásához.
Jövőbeli kutatási irányok, együttműködési lehetőségek: bioinformatikai tantárgyfejlesztés (BSc, MSc és PhD), újszerű adatok megértése, adatbázis tervezés.
